Introduction et définitions générales
L’objectif de ce texte est de présenter une synthèse de l’origine (provenance) ainsi que de la structure macromoléculaire générale du virus de la famille des coronaviridae, le SARS-CoV-2 qui est responsable de la pandémie la plus mortelle de l’ère moderne depuis la grippe de Hong Kong qui a fortement atteint la population mondiale causant près d’un million de décès entre 1968 et 1970 (1).
Les nuances sur l’origine du SARS-CoV-2 permettront d’en savoir davantage sur ce que doit posséder comme propriétés un coronavirus pour envahir le corps humain. La structure macromoléculaire du virus est intimement liée à son origine et la connaissance de certaines protéines clefs du SARS-CoV-2 permettra d’aborder les façons de doser ce virus ou de révéler sa présence dans les fluides corporels (article partie 2, à venir).
Il apparaît nécessaire de présenter quelques définitions afin de savoir exactement de quoi il retourne et d’éviter les abus de langage qui risque d’induire les gens en erreur. En premier lieu, l’acronyme utilisé couramment est COVID-19, il décrit la maladie lorsqu’une personne souffre d’une atteinte particulière à ce virus et ne correspond pas à l’acronyme pour énoncer ou décrire ce coronavirus. L’acronyme adapté pour énoncer le virus est le SRAS-CoV-2 ou en anglais le SARS-CoV-2. C’est d’ailleurs ce dernier acronyme qui sera utilisé dans ce texte puisqu’il est le terme officiel du Comité international de taxonomie des virus (toutefois il a également été francisé en SRAS-CoV-2 pour assurer la cohérence avec l’épidémie de SRAS dont le terme avait alors été francisé) (2). Il est à noter que le virus SRAS-CoV-2 n’est pas le descendant direct du virus SARS-CoV (crise du SRAS en 2002-2003). L’homologie entre ces deux virus porte plutôt sur la similarité de certains signes cliniques de la maladie SRAS et COVID-19, mais pas sur le plan de la phylogénétique du virus.
